Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ9

Ddx50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx50Q99MJ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx50Q99MJ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx50Q99MJ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx50Q99MJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx50Q99MJ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddx50Q99MJ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx50Q99MJ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddx50Q99MJ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ddx50Q99MJ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx50Q99MJ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx50Q99MJ9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx50Q99MJ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddx50Q99MJ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx50Q99MJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx50Q99MJ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ddx50Q99MJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx50Q99MJ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx50Q99MJ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ddx50Q99MJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx50Q99MJ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx50Q99MJ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddx50Q99MJ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx50Q99MJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx50Q99MJ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms