Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtpbp4Q99ME9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtpbp4Q99ME9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtpbp4Q99ME9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtpbp4Q99ME9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtpbp4Q99ME9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtpbp4Q99ME9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtpbp4Q99ME9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtpbp4Q99ME9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtpbp4Q99ME9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtpbp4Q99ME9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtpbp4Q99ME9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtpbp4Q99ME9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtpbp4Q99ME9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtpbp4Q99ME9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gtpbp4Q99ME9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtpbp4Q99ME9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtpbp4Q99ME9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms