Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcc1Q99LI2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcc1Q99LI2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcc1Q99LI2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcc1Q99LI2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Clcc1Q99LI2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcc1Q99LI2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clcc1Q99LI2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcc1Q99LI2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms