Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcf2Q99LE6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Abcf2Q99LE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abcf2Q99LE6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcf2Q99LE6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcf2Q99LE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcf2Q99LE6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcf2Q99LE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcf2Q99LE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms