Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PpifQ99KR7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PpifQ99KR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpifQ99KR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PpifQ99KR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpifQ99KR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PpifQ99KR7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms