Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pacsin3Q99JB8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pacsin3Q99JB8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacsin3Q99JB8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pacsin3Q99JB8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin3Q99JB8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin3Q99JB8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacsin3Q99JB8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms