Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Derl1Q99J56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Derl1Q99J56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Derl1Q99J56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Derl1Q99J56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Derl1Q99J56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Derl1Q99J56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms