Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prpf6Q91YR7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Prpf6Q91YR7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf6Q91YR7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf6Q91YR7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf6Q91YR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf6Q91YR7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prpf6Q91YR7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prpf6Q91YR7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prpf6Q91YR7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prpf6Q91YR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prpf6Q91YR7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Prpf6Q91YR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpf6Q91YR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpf6Q91YR7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms