Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atl3Q91YH5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atl3Q91YH5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atl3Q91YH5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atl3Q91YH5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atl3Q91YH5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Atl3Q91YH5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atl3Q91YH5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atl3Q91YH5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Atl3Q91YH5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atl3Q91YH5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms