Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcdhga12Q91XY7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdhga12Q91XY7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhga12Q91XY7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhga12Q91XY7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga12Q91XY7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhga12Q91XY7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhga12Q91XY7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhga12Q91XY7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhga12Q91XY7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms