Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx15Q91WE1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx15Q91WE1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx15Q91WE1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx15Q91WE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx15Q91WE1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx15Q91WE1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx15Q91WE1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms