Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Cox4i2Q91W29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,64■■□□□ 1,06
Cox4i2Q91W29 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cox4i2Q91W29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Cox4i2Q91W29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Cox4i2Q91W29 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Cox4i2Q91W29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Cox4i2Q91W29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,1 ms