Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NifkQ91VE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NifkQ91VE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NifkQ91VE6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NifkQ91VE6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NifkQ91VE6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NifkQ91VE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms