Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vsx1Q91V10 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vsx1Q91V10 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vsx1Q91V10 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vsx1Q91V10 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vsx1Q91V10 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vsx1Q91V10 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vsx1Q91V10 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsx1Q91V10 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms