Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SelenomQ8VHC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SelenomQ8VHC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SelenomQ8VHC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelenomQ8VHC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenomQ8VHC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SelenomQ8VHC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SelenomQ8VHC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms