Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rprd1aQ8VDS4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rprd1aQ8VDS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rprd1aQ8VDS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Rprd1aQ8VDS4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rprd1aQ8VDS4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Rprd1aQ8VDS4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Rprd1aQ8VDS4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rprd1aQ8VDS4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Rprd1aQ8VDS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Rprd1aQ8VDS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Rprd1aQ8VDS4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Rprd1aQ8VDS4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Rprd1aQ8VDS4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,14■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rprd1aQ8VDS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,9 ms