Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC82

Rhbdl1, Rhomboid-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl1Q8VC82 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl1Q8VC82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhbdl1Q8VC82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhbdl1Q8VC82 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl1Q8VC82 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl1Q8VC82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rhbdl1Q8VC82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhbdl1Q8VC82 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.8 ms