Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Prpsap2Q8R574 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Prpsap2Q8R574 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Prpsap2Q8R574 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Prpsap2Q8R574 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Prpsap2Q8R574 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Prpsap2Q8R574 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Prpsap2Q8R574 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Prpsap2Q8R574 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Prpsap2Q8R574 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Prpsap2Q8R574 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Prpsap2Q8R574 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Prpsap2Q8R574 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms