Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd8Q8R3B7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd8Q8R3B7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd8Q8R3B7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd8Q8R3B7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd8Q8R3B7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd8Q8R3B7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brd8Q8R3B7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd8Q8R3B7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd8Q8R3B7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd8Q8R3B7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd8Q8R3B7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brd8Q8R3B7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd8Q8R3B7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd8Q8R3B7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd8Q8R3B7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd8Q8R3B7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd8Q8R3B7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd8Q8R3B7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd8Q8R3B7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms