Protein–RNA interactions for Protein: Q8R238

Sdsl, Serine dehydratase-like, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdslQ8R238 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SdslQ8R238 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdslQ8R238 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SdslQ8R238 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SdslQ8R238 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SdslQ8R238 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SdslQ8R238 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SdslQ8R238 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SdslQ8R238 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms