Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RorbQ8R1B8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RorbQ8R1B8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RorbQ8R1B8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RorbQ8R1B8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RorbQ8R1B8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RorbQ8R1B8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms