Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gga1Q8R0H9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gga1Q8R0H9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gga1Q8R0H9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gga1Q8R0H9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gga1Q8R0H9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gga1Q8R0H9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gga1Q8R0H9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga1Q8R0H9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gga1Q8R0H9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga1Q8R0H9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms