Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N3

Vmn1r189, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r189Q8K3N3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r189Q8K3N3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r189Q8K3N3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r189Q8K3N3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r189Q8K3N3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r189Q8K3N3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r189Q8K3N3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r189Q8K3N3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r189Q8K3N3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms