Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrpl47Q8K2Y7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl47Q8K2Y7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl47Q8K2Y7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl47Q8K2Y7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrpl47Q8K2Y7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrpl47Q8K2Y7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrpl47Q8K2Y7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl47Q8K2Y7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl47Q8K2Y7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrpl47Q8K2Y7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl47Q8K2Y7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms