Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arfip2Q8K221 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arfip2Q8K221 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfip2Q8K221 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfip2Q8K221 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arfip2Q8K221 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arfip2Q8K221 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arfip2Q8K221 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arfip2Q8K221 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arfip2Q8K221 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms