Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkd3Q8K1Y2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkd3Q8K1Y2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkd3Q8K1Y2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkd3Q8K1Y2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkd3Q8K1Y2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkd3Q8K1Y2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkd3Q8K1Y2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms