Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnpt1Q8K1R3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnpt1Q8K1R3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnpt1Q8K1R3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pnpt1Q8K1R3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pnpt1Q8K1R3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pnpt1Q8K1R3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pnpt1Q8K1R3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pnpt1Q8K1R3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pnpt1Q8K1R3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pnpt1Q8K1R3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pnpt1Q8K1R3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpt1Q8K1R3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pnpt1Q8K1R3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnpt1Q8K1R3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnpt1Q8K1R3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pnpt1Q8K1R3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pnpt1Q8K1R3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms