Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1K9

Hinfp, Histone H4 transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HinfpQ8K1K9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HinfpQ8K1K9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HinfpQ8K1K9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HinfpQ8K1K9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HinfpQ8K1K9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HinfpQ8K1K9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HinfpQ8K1K9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HinfpQ8K1K9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms