Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc47a1Q8K0H1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc47a1Q8K0H1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc47a1Q8K0H1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc47a1Q8K0H1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc47a1Q8K0H1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc47a1Q8K0H1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms