Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Habp2Q8K0D2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Habp2Q8K0D2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Habp2Q8K0D2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp2Q8K0D2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Habp2Q8K0D2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Habp2Q8K0D2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.9 ms