Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0C1

Ipo13, Importin-13, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo13Q8K0C1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ipo13Q8K0C1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ipo13Q8K0C1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ipo13Q8K0C1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ipo13Q8K0C1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ipo13Q8K0C1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ipo13Q8K0C1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ipo13Q8K0C1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ipo13Q8K0C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ipo13Q8K0C1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ipo13Q8K0C1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ipo13Q8K0C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ipo13Q8K0C1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ipo13Q8K0C1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ipo13Q8K0C1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ipo13Q8K0C1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ipo13Q8K0C1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms