Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trip10Q8CJ53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trip10Q8CJ53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trip10Q8CJ53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trip10Q8CJ53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trip10Q8CJ53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trip10Q8CJ53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms