Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prmt5Q8CIG8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prmt5Q8CIG8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prmt5Q8CIG8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prmt5Q8CIG8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prmt5Q8CIG8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Prmt5Q8CIG8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms