Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc49a3Q8CE47 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc49a3Q8CE47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc49a3Q8CE47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc49a3Q8CE47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc49a3Q8CE47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc49a3Q8CE47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc49a3Q8CE47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc49a3Q8CE47 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc49a3Q8CE47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc49a3Q8CE47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc49a3Q8CE47 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc49a3Q8CE47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms