Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrif1Q8CDD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrif1Q8CDD9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrif1Q8CDD9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrif1Q8CDD9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrif1Q8CDD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrif1Q8CDD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrif1Q8CDD9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrif1Q8CDD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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