Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
E4f1Q8CCE9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
E4f1Q8CCE9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
E4f1Q8CCE9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
E4f1Q8CCE9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
E4f1Q8CCE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
E4f1Q8CCE9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
E4f1Q8CCE9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
E4f1Q8CCE9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
E4f1Q8CCE9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
E4f1Q8CCE9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E4f1Q8CCE9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
E4f1Q8CCE9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E4f1Q8CCE9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
E4f1Q8CCE9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms