Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa5Q8C7G5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa5Q8C7G5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apoa5Q8C7G5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apoa5Q8C7G5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoa5Q8C7G5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoa5Q8C7G5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoa5Q8C7G5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoa5Q8C7G5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoa5Q8C7G5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoa5Q8C7G5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoa5Q8C7G5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms