Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccz1Q8C1Y8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccz1Q8C1Y8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccz1Q8C1Y8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccz1Q8C1Y8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccz1Q8C1Y8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccz1Q8C1Y8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccz1Q8C1Y8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccz1Q8C1Y8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccz1Q8C1Y8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccz1Q8C1Y8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms