Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q8C1R3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q8C1R3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q8C1R3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8C1R3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q8C1R3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q8C1R3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q8C1R3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q8C1R3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8C1R3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8C1R3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q8C1R3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8C1R3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q8C1R3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8C1R3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8C1R3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8C1R3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8C1R3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8C1R3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms