Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0T1

Fem1ab, Protein fem-1 homolog A-B, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fem1abQ8C0T1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fem1abQ8C0T1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fem1abQ8C0T1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fem1abQ8C0T1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fem1abQ8C0T1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fem1abQ8C0T1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fem1abQ8C0T1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fem1abQ8C0T1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fem1abQ8C0T1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fem1abQ8C0T1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fem1abQ8C0T1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fem1abQ8C0T1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fem1abQ8C0T1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fem1abQ8C0T1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms