Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ81

Lrrtm3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, mousemouse

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm3Q8BZ81 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrtm3Q8BZ81 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrtm3Q8BZ81 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrtm3Q8BZ81 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrtm3Q8BZ81 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrtm3Q8BZ81 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrtm3Q8BZ81 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrtm3Q8BZ81 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrtm3Q8BZ81 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrtm3Q8BZ81 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrtm3Q8BZ81 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrtm3Q8BZ81 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrtm3Q8BZ81 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrtm3Q8BZ81 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrtm3Q8BZ81 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrtm3Q8BZ81 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrtm3Q8BZ81 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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