Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsfm13Q8BXS2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms