Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Larp4Q8BWW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Larp4Q8BWW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Larp4Q8BWW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Larp4Q8BWW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Larp4Q8BWW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Larp4Q8BWW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Larp4Q8BWW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms