Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW45

E330021D16Rik, RIKEN cDNA E330021D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330021D16RikQ8BW45 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E330021D16RikQ8BW45 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E330021D16RikQ8BW45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E330021D16RikQ8BW45 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E330021D16RikQ8BW45 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E330021D16RikQ8BW45 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E330021D16RikQ8BW45 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E330021D16RikQ8BW45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms