Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVC4

Ccdc68, Coiled-coil domain-containing protein 68, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc68Q8BVC4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc68Q8BVC4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc68Q8BVC4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc68Q8BVC4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc68Q8BVC4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc68Q8BVC4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc68Q8BVC4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc68Q8BVC4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc68Q8BVC4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc68Q8BVC4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc68Q8BVC4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms