Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
E330017A01RikQ8BU47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,21■■□□□ 1,63
E330017A01RikQ8BU47 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
E330017A01RikQ8BU47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
E330017A01RikQ8BU47 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,06■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,05■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
E330017A01RikQ8BU47 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,99■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
E330017A01RikQ8BU47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
E330017A01RikQ8BU47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
E330017A01RikQ8BU47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
E330017A01RikQ8BU47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
E330017A01RikQ8BU47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
E330017A01RikQ8BU47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
E330017A01RikQ8BU47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24,88■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
E330017A01RikQ8BU47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,8■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
E330017A01RikQ8BU47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms