Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTK5

Smyd4, SET and MYND domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd4Q8BTK5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd4Q8BTK5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smyd4Q8BTK5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smyd4Q8BTK5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smyd4Q8BTK5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smyd4Q8BTK5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smyd4Q8BTK5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd4Q8BTK5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd4Q8BTK5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd4Q8BTK5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd4Q8BTK5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd4Q8BTK5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd4Q8BTK5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd4Q8BTK5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smyd4Q8BTK5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd4Q8BTK5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd4Q8BTK5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd4Q8BTK5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms