Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lig4Q8BTF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lig4Q8BTF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lig4Q8BTF7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lig4Q8BTF7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig4Q8BTF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig4Q8BTF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lig4Q8BTF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lig4Q8BTF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lig4Q8BTF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lig4Q8BTF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lig4Q8BTF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lig4Q8BTF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lig4Q8BTF7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms