Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Klhl38Q8BSF5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl38Q8BSF5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl38Q8BSF5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klhl38Q8BSF5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klhl38Q8BSF5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl38Q8BSF5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl38Q8BSF5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl38Q8BSF5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl38Q8BSF5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl38Q8BSF5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms