Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRK8

Prkaa2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa2Q8BRK8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkaa2Q8BRK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkaa2Q8BRK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkaa2Q8BRK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkaa2Q8BRK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa2Q8BRK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkaa2Q8BRK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa2Q8BRK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkaa2Q8BRK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkaa2Q8BRK8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkaa2Q8BRK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkaa2Q8BRK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prkaa2Q8BRK8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa2Q8BRK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms